1、现在只有地表水和地下水可以作为水资源。废水再生水能否用作水资源尚不确定，这就为监管带来一系列的问题。

　　2、中水回用工程是一项资金投入巨大，且资金回笼慢的投资，许多企业单位都不愿投资。然而，与中水配套的管道网络建设严重滞后，经城镇废水处理厂处理之后的中水也只能白白浪费，造成资金和人力的极大损失，这也阻碍了中水回用的快速推广。

　　3、从技术管理的角度看，由于水质的不稳定，会影响中水回用设备的正常使用。目前，我国废水处理厂在运行中存在一些问题，难以保证中水回用的正常进行。由于水质问题，在输送过程中经常发生管道结垢。